Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEPROQ6NW34 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEPROQ6NW34 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms