Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RALGAPA1Q6GYQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms