Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUPD1Q68J44 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUPD1Q68J44 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms