Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL6IP4Q66PJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARL6IP4Q66PJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL6IP4Q66PJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL6IP4Q66PJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL6IP4Q66PJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL6IP4Q66PJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL6IP4Q66PJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms