Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCNX4Q63HM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX4Q63HM2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX4Q63HM2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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