Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ECM29Q5VYK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECM29Q5VYK3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms