Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SUSD4Q5VX71 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms