Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RSPH4AQ5TD94 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RSPH4AQ5TD94 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms