Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MARCH8Q5T0T0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH8Q5T0T0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms