Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4BQ5PRF9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4BQ5PRF9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms