Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRDTQ58F21 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms