Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SDK2Q58EX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SDK2Q58EX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SDK2Q58EX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms