Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC3BQ53EP0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3BQ53EP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms