Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO43Q4G163 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO43Q4G163 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms