Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CFAP100Q494V2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP100Q494V2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms