Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBR1Q16650 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBR1Q16650 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBR1Q16650 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBR1Q16650 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBR1Q16650 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBR1Q16650 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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