Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF11Q15544 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF11Q15544 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms