Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDSNQ15517 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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