Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
R3HDM1Q15032 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
R3HDM1Q15032 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
R3HDM1Q15032 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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