Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAPTM4AQ15012 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAPTM4AQ15012 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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