Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSME4Q14997 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSME4Q14997 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSME4Q14997 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms