Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4AQ14139 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4AQ14139 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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