Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCINQ13939 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCINQ13939 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCINQ13939 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCINQ13939 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCINQ13939 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCINQ13939 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCINQ13939 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCINQ13939 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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