Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCIRG1Q13488 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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