Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAPPAQ13219 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAPPAQ13219 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAPPAQ13219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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