Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 RAD7YJR052W 1698 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MDM38YOL027C 1722 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 CPR4YCR069W 957 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 MCM21YDR318W 1107 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YGL118CYGL118C 438 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YGL152CYGL152C 678 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 PEX12YMR026C 1200 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YOR379CYOR379C 339 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 CNS1YBR155W 1158 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 RER1YCL001W 567 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 RSM23YGL129C 1353 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 GDH2YDL215C 3279 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 IMD3YLR432W 1572 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 THS1YIL078W 2205 nt4.87□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 PTR3YFR029W 2037 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YER077CYER077C 2067 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YCR101CYCR101C 549 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 ECM34YHL043W 513 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 RPS4BYHR203C 786 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 RPS4AYJR145C 786 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YIM1YMR152W 1098 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 TGS1YPL157W 948 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 RPL19AYBR084C-A 570 nt4.86□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 DPB4YDR121W 591 nt4.85□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 OAR1YKL055C 837 nt4.85□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 ADD66YKL206C 804 nt4.85□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YMR1YJR110W 2067 nt4.85□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SAP4YGL229C 2457 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 TRM44YPL030W 1704 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 YRB30YGL164C 1323 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SRO9YCL037C 1305 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 EDC1YGL222C 528 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 SNF8YPL002C 702 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 snR34snR34 203 nt4.84□□□□□ -1.63
RTP1Q12751 NUS1YDL193W 1128 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 RPL34AYER056C-A 366 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 CNB1YKL190W 528 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YLR049CYLR049C 1287 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 IBD2YNL164C 1056 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 FES1YBR101C 873 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.83□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 GSM1YJL103C 1857 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 MAF1YDR005C 1188 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 DUO1YGL061C 744 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YIL089WYIL089W 618 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 PIR3YKL163W 978 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 GCD7YLR291C 1146 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YNR068CYNR068C 819 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 AIM39YOL053W 1188 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 GZF3YJL110C 1656 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 MET12YPL023C 1974 nt4.82□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SWP82YFL049W 1872 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 RVB1YDR190C 1392 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 MDM34YGL219C 1380 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SUT1YGL162W 900 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YKL177WYKL177W 339 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 EUG1YDR518W 1554 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YLR345WYLR345W 1530 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 HOT1YMR172W 2160 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SKG3YLR187W 3081 nt4.81□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 KGD1YIL125W 3045 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 HPR1YDR138W 2259 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 RDH54YBR073W 2877 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SNA2YDR525W-A 240 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YHL049CYHL049C 816 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 COA3YJL062W-A 258 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 DCS1YLR270W 1053 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 IMP2YMR035W 534 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YAR1YPL239W 603 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 APP1YNL094W 1764 nt4.8□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 NMD3YHR170W 1557 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 ABD1YBR236C 1311 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 UBP6YFR010W 1500 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 TMA17YDL110C 453 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 RCR2YDR003W 633 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SDT1YGL224C 843 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 HRT1YOL133W 366 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 IDI1YPL117C 867 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 GLO3YER122C 1482 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YGR266WYGR266W 2106 nt4.79□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 RRB1YMR131C 1536 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 MSN4YKL062W 1893 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 YCL068CYCL068C 783 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 ARG82YDR173C 1068 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 SSB2YNL209W 1842 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 KIN2YLR096W 3444 nt4.78□□□□□ -1.64
RTP1Q12751 HMS1YOR032C 1305 nt4.77□□□□□ -1.65
RTP1Q12751 YML020WYML020W 1995 nt4.77□□□□□ -1.65
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