Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 TED1YIL039W 1422 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 SAS10YDL153C 1833 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 ECM16YMR128W 3804 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 STI1YOR027W 1770 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 HOM2YDR158W 1098 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 ARR1YPR199C 885 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 RPS9BYBR189W 588 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 STP22YCL008C 1158 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 ATG11YPR049C 3537 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 INO80YGL150C 4470 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 NKP1YDR383C 717 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 PAN5YHR063C 1140 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 RPL8BYLL045C 771 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YLR156WYLR156W 345 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YLR159WYLR159W 345 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YLR161WYLR161W 345 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 snR32snR32 188 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 snR42snR42 351 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 PFK26YIL107C 2484 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 IRC18YJL037W 675 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 ECM22YLR228C 2445 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 RSE1YML049C 4086 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 TCB2YNL087W 3537 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 YTA6YPL074W 2265 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 LEU1YGL009C 2340 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 CDC26YFR036W 375 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 ECM34YHL043W 513 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 MIS1YBR084W 2928 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 NOP4YPL043W 2058 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 YMR317WYMR317W 3423 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 BMH2YDR099W 822 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 HAT2YEL056W 1206 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 SHO1YER118C 1104 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 MRP13YGR084C 1020 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 BUD27YFL023W 2391 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 REC104YHR157W 549 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 PBP2YBR233W 1242 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 HSP42YDR171W 1128 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 MDM12YOL009C 816 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 MEC3YLR288C 1425 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 YGL108CYGL108C 423 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 ECM32YER176W 3366 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 CHL4YDR254W 1377 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 ORC1YML065W 2745 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-GR3Q12316 URA7YBL039C 1740 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 ELM1YKL048C 1923 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 DNA2YHR164C 4569 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 PCA1YBR295W 3651 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 PEA2YER149C 1263 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 GOT1YMR292W 417 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YNL320WYNL320W 855 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 MED4YOR174W 855 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 PAP1YKR002W 1707 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 PUS7YOR243C 2031 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 HAL5YJL165C 2568 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YHR202WYHR202W 1809 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 UBP13YBL067C 2244 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 UBA2YDR390C 1911 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YHL026CYHL026C 948 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YPT7YML001W 627 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 TPO2YGR138C 1845 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 FAD1YDL045C 921 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YJL218WYJL218W 591 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YJR020WYJR020W 333 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 YRA2YKL214C 612 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 SGT1YOR057W 1188 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 SOF1YLL011W 1470 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 RAD53YPL153C 2466 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 SWP82YFL049W 1872 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1B-GR3Q12316 GAC1YOR178C 2382 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 TRP4YDR354W 1143 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 RUF5-1RUF5-1 710 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 NRM1YNR009W 750 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 RUF5-2RUF5-2 710 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 SMC3YJL074C 3693 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 RPL34AYER056C-A 366 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 ENA2YDR039C 3276 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 ENA1YDR040C 3276 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 PRP40YKL012W 1752 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 YND1YER005W 1893 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 ERG2YMR202W 669 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 MED7YOL135C 669 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 NTO1YPR031W 2247 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 SET5YHR207C 1581 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 MKC7YDR144C 1791 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 HMF1YER057C 390 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 INN1YNL152W 1230 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR3Q12316 UTP23YOR004W 765 nt5□□□□□ -1.61
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