Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 HOT13YKL084W 351 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 JLP1YLL057C 1239 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 URA4YLR420W 1095 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YPR142CYPR142C 564 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 CNS1YBR155W 1158 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 NNK1YKL171W 2787 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 NPL4YBR170C 1743 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MNN1YER001W 2289 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 CDC15YAR019C 2925 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RIM21YNL294C 1602 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SRO9YCL037C 1305 nt4.2□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RCK2YLR248W 1833 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 NUP2YLR335W 2163 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RRP45YDR280W 918 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MDJ2YNL328C 441 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YOR342CYOR342C 960 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MUM2YBR057C 1101 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 GRC3YLL035W 1899 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RRP3YHR065C 1506 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YBR139WYBR139W 1527 nt4.19□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YER158CYER158C 1722 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TRM44YPL030W 1704 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TUB2YFL037W 1374 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YCR015CYCR015C 954 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YDL186WYDL186W 834 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 GIC2YDR309C 1152 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 NOP16YER002W 696 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YFL068WYFL068W 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 NAT2YGR147C 867 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YIL163CYIL163C 354 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YJR012CYJR012C 624 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YKL177WYKL177W 339 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MTD1YKR080W 963 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 ERD2YBL040C 660 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SSB1YDL229W 1842 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YAP1802YGR241C 1707 nt4.18□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SBE2YDR351W 2595 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MDL1YLR188W 2088 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RAD28YDR030C 1521 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YLR345WYLR345W 1530 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 CYM1YDR430C 2970 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YGR269WYGR269W 327 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SHE1YBL031W 1017 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 PNT1YOR266W 1272 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SET6YPL165C 1122 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TOM5YPR133W-A 153 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 GDE1YPL110C 3672 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 HRR25YPL204W 1485 nt4.17□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 LAP3YNL239W 1365 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YGL193CYGL193C 312 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 VMA22YHR060W 546 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 ALB1YJL122W 528 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 AAD10YJR155W 867 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TVP38YKR088C 1014 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YLR042CYLR042C 486 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RUF21RUF21 707 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 YNR042WYNR042W 429 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SUT2YPR009W 807 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 ORC6YHR118C 1308 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 FDC1YDR539W 1512 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 DRN1YGR093W 1524 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 NGL3YML118W 1518 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 MMT1YMR177W 1533 nt4.16□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 TRM1YDR120C 1713 nt4.15□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 SSA2YLL024C 1920 nt4.15□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 IMA3YIL172C 1770 nt4.15□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 IMA4YJL221C 1770 nt4.15□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 PUT1YLR142W 1431 nt4.15□□□□□ -1.74
SSK1Q07084 RRP8YDR083W 1179 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 HIS6YIL020C 786 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 IMP2YMR035W 534 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YNL226WYNL226W 411 nt4.15□□□□□ -1.75
SSK1Q07084 YBL096CYBL096C 309 nt4.15□□□□□ -1.75
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