Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCDQ05655 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKCDQ05655 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms