Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 CDC48YDL126C 2508 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 ENT5YDR153C 1236 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 AIM23YJL131C 1071 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MDG1YNL173C 1101 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 ZPS1YOL154W 750 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YOL162WYOL162W 648 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YPL199CYPL199C 723 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MDM30YLR368W 1797 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 RSC6YCR052W 1452 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PDR5YOR153W 4536 nt5.18□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SPO1YNL012W 1896 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SYF1YDR416W 2580 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 LYS2YBR115C 4179 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 OPT2YPR194C 2634 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MSC2YDR205W 2175 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 HOT1YMR172W 2160 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 TIF4632YGL049C 2745 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SHR3YDL212W 633 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 CLC1YGR167W 702 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 DID4YKL002W 699 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 ECM15YBL001C 315 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YMR245WYMR245W 621 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PEX27YOR193W 1131 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 OM14YBR230C 405 nt5.17□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 PHO87YCR037C 2772 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 NOP16YER002W 696 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MMM1YLL006W 1281 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YLR366WYLR366W 306 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 IMP2YMR035W 534 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 RIT1YMR283C 1542 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SSB1YDL229W 1842 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 SSB2YNL209W 1842 nt5.16□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 TED1YIL039W 1422 nt5.15□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 GZF3YJL110C 1656 nt5.15□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 MCH4YOL119C 1506 nt5.15□□□□□ -1.58
CEF1Q03654 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 SLC1YDL052C 912 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 CDC73YLR418C 1182 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 ATG16YMR159C 453 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 IBD2YNL164C 1056 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 RER1YCL001W 567 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 CLF1YLR117C 2064 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 IMD3YLR432W 1572 nt5.15□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 ECM34YHL043W 513 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 GMH1YKR030W 822 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 URA4YLR420W 1095 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YNL303WYNL303W 348 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 snR10snR10 245 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 TRS33YOR115C 807 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 NCE102YPR149W 522 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 MGS1YNL218W 1764 nt5.14□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YCL068CYCL068C 783 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YDR417CYDR417C 372 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 PAN5YHR063C 1140 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 OAR1YKL055C 837 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 DCS1YLR270W 1053 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 THI80YOR143C 960 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 APP1YNL094W 1764 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 PUT1YLR142W 1431 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 UBP10YNL186W 2379 nt5.13□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 ROT2YBR229C 2865 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 GSM1YJL103C 1857 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 TPS3YMR261C 3165 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 MSS2YDL107W 1056 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 RRP17YDR412W 708 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 PEX21YGR239C 867 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 LIP2YLR239C 987 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 NIT3YLR351C 876 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 RAD10YML095C 633 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 SPG4YMR107W 348 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 TEX1YNL253W 1269 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 TLG2YOL018C 1194 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 GLO4YOR040W 858 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YAR1YPL239W 603 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 NHP6AYPR052C 282 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 QCR2YPR191W 1107 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 TDA7YNL176C 1911 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YRB30YGL164C 1323 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 HES1YOR237W 1305 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 HRR25YPL204W 1485 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 HXT14YNL318C 1623 nt5.12□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 GIP4YAL031C 2283 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 MHF2YDL160C-A 243 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 BUD26YDR241W 288 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 DCV1YFR012W 609 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 GEP7YGL057C 864 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 TRX2YGR209C 315 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 HIS6YIL020C 786 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 SUI2YJR007W 915 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 MRPL39YML009C 213 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YIF1YNL263C 945 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 OSW1YOR255W 837 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 PRM4YPL156C 855 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 SUT2YPR009W 807 nt5.11□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 PAD1YDR538W 729 nt5.1□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 RPL34AYER056C-A 366 nt5.1□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 YGR153WYGR153W 654 nt5.1□□□□□ -1.59
CEF1Q03654 PIR3YKL163W 978 nt5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.6 ms