Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms