Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP1Q00587 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP1Q00587 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms