Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDLBPQ00341 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDLBPQ00341 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms