Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP4P57796 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CABP4P57796 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CABP4P57796 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CABP4P57796 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP4P57796 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP4P57796 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP4P57796 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP4P57796 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CABP4P57796 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CABP4P57796 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP4P57796 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP4P57796 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP4P57796 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP4P57796 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP4P57796 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP4P57796 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP4P57796 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP4P57796 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP4P57796 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP4P57796 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP4P57796 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP4P57796 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP4P57796 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP4P57796 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP4P57796 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP4P57796 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP4P57796 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP4P57796 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms