Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
SMARCA4P51532 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA4P51532 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SMARCA4P51532 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA4P51532 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms