Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK1EP49674 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK1EP49674 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK1EP49674 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms