Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI2P48788 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI2P48788 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms