Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSSP48449 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSSP48449 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSSP48449 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSSP48449 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSSP48449 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSSP48449 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSSP48449 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSSP48449 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms