Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX9P48436 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX9P48436 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX9P48436 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX9P48436 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX9P48436 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX9P48436 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX9P48436 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX9P48436 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX9P48436 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX9P48436 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX9P48436 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX9P48436 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX9P48436 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX9P48436 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX9P48436 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX9P48436 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX9P48436 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX9P48436 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX9P48436 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX9P48436 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX9P48436 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms