Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFRSF4P43489 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF4P43489 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms