Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDIT3P35638 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDIT3P35638 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms