Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT9P35527 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT9P35527 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT9P35527 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT9P35527 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT9P35527 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT9P35527 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT9P35527 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT9P35527 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT9P35527 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT9P35527 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT9P35527 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT9P35527 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms