Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC8P31273 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC8P31273 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms