Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBL1P28749 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBL1P28749 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBL1P28749 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBL1P28749 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBL1P28749 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBL1P28749 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBL1P28749 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RBL1P28749 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBL1P28749 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBL1P28749 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RBL1P28749 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms