Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DNMT1P26358 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DNMT1P26358 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms