Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL17P18621 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL17P18621 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL17P18621 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL17P18621 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL17P18621 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL17P18621 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL17P18621 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL17P18621 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms