Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FLT1P17948 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT1P17948 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT1P17948 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT1P17948 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT1P17948 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT1P17948 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT1P17948 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT1P17948 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT1P17948 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT1P17948 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT1P17948 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT1P17948 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT1P17948 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT1P17948 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT1P17948 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT1P17948 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT1P17948 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FLT1P17948 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FLT1P17948 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FLT1P17948 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FLT1P17948 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms