Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms