Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA1P17302 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA1P17302 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA1P17302 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA1P17302 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA1P17302 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA1P17302 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJA1P17302 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms