Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPA2P15927 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA2P15927 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA2P15927 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA2P15927 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA2P15927 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA2P15927 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA2P15927 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA2P15927 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPA2P15927 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms